TCGAbiolinks包报错:“Can't subset columns past the end”
2022年4月,TCGA数据库进行了一次更新,原来的HT-RNASeq数据被替换成了Star-RNASeq,这导致原有的TCGAbiolinks包能正常下载数据,但是不能用GDCprepare函数正常合并下载的数据集。如果用之前版本的包,在尝试这一步的时候会报错。
ERROR: Can't subset columns past the end
解决的办法就是升级TCGABiolinks这个包,