编程开发

展示DAVID富集分析结果中感兴趣的GO条目和KEGG通路

相信大家对GO和KEGG富集分析并不陌生,有时候富集分析会得到很多显著的结果。全部展示,版面不够。但是如果只展示前几个显著的GO条目或者KEGG通路的话,跟自己研究的对象相关的又不在里面。 今天小编就来帮助大家解决这个尴尬的问题,把我们感兴趣的GO条目和KEGG通路挑出来,然后再来画图。有人可能要抬杠了,这不是伪造数据吗?NO,NO, NO, 我们挑选出来展示的结果肯定也要是显著的。我们没有篡改任

两个年轻人的回复

同样的几个问题,我问了两个年轻人,得到了两个结果。一个说,“这些题我也没有具体做过,网上应该有,你从网上搜索一下吧!”我说,好的,谢谢你!我应该也知道网上是有的。另一个回答,“我没有做过,但我可以问一下学过的人,我可以查一下,大概知道方向。”我说非常感谢,她说,给你帮忙,我感到非常荣幸。 这两个年轻人对这几个问题都是没有见过,没有做过,但回答的语气不一样,态度不一样,你会更喜欢哪一个年轻人呢?如果

Pyscenic 转录因子分析feather V2 问题

dbs = [RankingDatabase(fname=fname, name=name(fname)) for fname in db_fnames] 进行至这一步的时候,出现如下错误:"hg19-tss-centered-5kb-10species.mc9nr.feather" is a cisTarget Feather database in Feather v1 format, whi

进程间通信方式总结

一、共享内存 一种常用的进程间共享方式,两个线程可以共享访问同一块内存区域,减少了数据的复制操作,因此具有速度上的优势,一般情况下实现共享内存的步骤如下: 1.创建共享区域,进程1首先通过操作系统提供的API从内存上申请一块共享区域,生成的共享区域将与某个特定的key进行绑定; 2.映射共享内存,成功创建了共享区域,我们需要把它映射到进程1的空间中才能进一步操作。 3.访问共享区域,进程1已经创建

567. 【自动化测试】测试配置管理模块

一个软件系统的配置具有多个层面,可以是系统级别的配置,也可以是功能级别的配置。很多开发人员有这样的经历——当一个功能某个变量需要通过配置来提供时,就会将这个变量放在配置文件中,并存放到一个特定目录下。如果没有一个统一的流程去规划这个过程,那么每个测试工程师都会按照自己喜欢的模式去定义配置文件格式,比如 XML、Properties、JSON等,并且都存放在自己认为合适的地方,导致配置文件混乱,不方

使用Rstudio下载GEO芯片数据

学习GEO芯片数据下载时踩了各种坑。记录如下: 跟从老师讲解,尝试使用GEOquery下载: library('GEOquery') library(dplyr) library(tidyverse) gset <- getGEO(GEO='GSE87211', destdir=".", getGPL = F) ### destdir存储目录位置,getGPL=F为拒绝下载注释文件 报错。

mamba极速安装conda包

conda有的时候真是太慢了,无论怎么改镜像,有的时候真的是慢的想让我炸掉电脑(看着那个不断旋转的圈圈就是蛋疼无比)。所以就有人提出了解决方案,那就是mamba。 有的人可能建议你如果有conda的话就这样安装,但是你很快就会看着不断转圈的conda陷入深思:这鬼东西到底什么时候才装的上,而且装的上有的时候一用就是依赖有问题 conda install -c conda-forge -n base

723 恭喜儿子面试第一

日更 723 天(2023 年 4 月 22 日 星期六 雨) 前天早上,儿子突然接到华中科技大学同济医学院的面试通知,儿子觉得不想去,我们也没有强求他,让他自己决定。 中午的时候,儿媳妇的姑妈姑爹电话说让他去面试,给自己多一个选择。 于是,他们两个临时决定去参加面试,买高铁票,买飞机票,一气呵成,运气非常好,时间都非常合适。 昨天上午,儿子微信发来消息,他面试成绩第一,远远超过第二名。 面试他们

三和ll我通过三笔一面了

早上睁开朦胧睡眼 手机赫然显示一条短信“录取通知:恭喜您…” 眼角甚至溢出泪水,感谢三和! 我可以同行了! 回想这一路走来 2月底报名 3月报名审核 3月底第一次笔试 4月底第二次笔试 5月中旬第三次笔试 8月中旬网络面试 拉了很长的战线 终于,在9月末有了结果 三笔一面结束了,接下来是新的开始! 前半年因为疫情我的舍友都未返校 一人的宿舍,行动自在 获得珍贵的独处时光 真的很开心,报考并认真

文件属性修改

每个文件的属性由左边第一部分的 10 个字符来确定(如下图)  1.chown:  更改文件属主,也可以同时更改文件属组         格式:                chown [–R] 属主名 文件名               chown [-R] 属主名:属组名 文件名          chown -R  test   1.log  :  将1.lo