什么是iqtree?
iqtree是一款构建进化树的软件,类似于phyml,raxml。
文章地址:W-IQ-TREE: a fast online phylogenetic tool for maximum likelihood analysis | Nucleic Acids Research | Oxford Academic (oup.com)
官方说这款软件相比于其他构树软件的优势在于:
空间转录组是2022生命科学十大创新产品名单,因此将来会在生物学领域有非常大的应用空间,目前植物类的相关文章较少,我也是在慢慢的学习中。我们测试数据选取兰花的空转数据:Spatiotemporal atlas of organogenesis in development of orchid flowers(这篇文章我前面也分享过),与单细胞的数据结构基本一致,多了spatial这个文件夹,主要包