空间转录组---seurat
空间转录组是2022生命科学十大创新产品名单，因此将来会在生物学领域有非常大的应用空间，目前植物类的相关文章较少，我也是在慢慢的学习中。我们测试数据选取兰花的空转数据：Spatiotemporal atlas of organogenesis in development of orchid flowers（这篇文章我前面也分享过），与单细胞的数据结构基本一致，多了spatial这个文件夹，主要包
人工智能
机器学习入门总结和各类常用神经网络汇总(第一篇)
这里总结了李宏毅老师的机器学习的课程。首先我们将会了解到机器学习的概念，但是课程的主要观点将会聚焦到Deep Learning。进行了解之后我们会学习到监督学习( supervised learning )的相关网络，还有自监督学习(self- supervised learning)的相关知识，包括生成对抗网络（GAN），BERT，Tansformer等。后面还会讲到强化学习（Reinforce
IQTREE 使用记录
什么是iqtree？
iqtree是一款构建进化树的软件，类似于phyml，raxml。
文章地址：W-IQ-TREE: a fast online phylogenetic tool for maximum likelihood analysis | Nucleic Acids Research | Oxford Academic (oup.com)
官方说这款软件相比于其他构树软件的优势在于：
GA-RPN：Region Proposal by Guided Anchoring 引导锚点的建议区域网络
原文链接
论文地址：
代码地址：GitHub - open-mmlab/mmdetection: OpenMMLab Detection Toolbox and Benchmark
1.RPN
RPN即Region Proposal Network，是用RON来选择感兴趣区域的，即proposal extraction。例如，
self-attention自注意力机制
看代码呆了半天，实在看不懂注意力机制是怎么回事，所以研究了一下原理
self.attention计算过程
query 就是自身的权重，key是其他的特征的权重，attention score就是其他权重和自身权重进行相乘得到的值
image.png
[图片上传中...(20220713_030107.png-765899-1657781807513-0)]
不
遍历并输出Map集合中的key值
遍历并输出Map集合中的key值，这个可是不简单。
看起来确实稍微好一点，但是实际上自己敲出来，就错误百出了。。、
import java.util.Collection;
import java.util.HashMap;
import java.util.Iterator;
import java.util.Map;
import java.util.Set;
public class Has
《Science》观点解读：AI无法创造真正的智能体（AI Agent）
无论是想要学习人工智能当做主业营收，还是像我一样作为开发工程师但依然要运用这个颠覆开发的时代宠儿，都有必要了解、学习一下人工智能。 近期发现了一个巨牛的人工智能学习网站，通俗易懂，风趣幽默，入行门槛低，讲解极为丰富。 点击跳转：前言 – 人工智能教程目录
《从0到神谕：GPT系列的进化狂想曲——用AI之眼见证人类语言的终极形态》
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