人工智能

重测序分析(18)GWAS分析实操(4)gwas_tassel_mlm

混合线性模型MLM:GLM模型中,如果两个表型差异很大,但群体本身还含有其他的遗传差异(如地域等),则那些与该表型无关的遗传差异也会影响到相关性。MLM模型可以把群体结构的影响设为协方差,把这种位点校正掉。此外,材料间的公共祖先关系也会导致非连锁相关,可加入亲缘关系矩阵作为随机效应来矫正。 数据准备 表型数据:sample.table Q矩阵:snp.3.Q vcf文件:all_s

Seurat数据结构学习.1

Seurat.obj.v3.png Seurat对象中的Assay: ###################################################################### 在-RNA槽: @counts:未作任何处理的原始RNA表达矩阵。 @data:原表达矩阵通过NormalizeData()归一化消除测序文库差异(对于每个细胞,将每个基因的表

R语言绘制组间比较散点图并自动添加P值信息

查询ggprism包使用时候发现官网给出的一示例图比较常用,这里记录学习一下。 image-20221208130405959 加载R包准备数据 ## 加载R包 sapply(c('dplyr',"ggplot2","ggprism", "ggbeeswarm","rstatix"), require, character.only = TRUE) ## 准备数

安全漏洞:非法的BigDecimal造成系统崩溃

原理 BigDecimal在JAVA中常用于金额的计算。BigDecimal表面上接收了科学计算法的参数然后进行了一个计算,但是没有对精度做校验。如果用户恶意的传入一个极大值,例如1e1111111或1e9999,那么会导致BigDecimal计算时间延迟很大,从而造成系统崩溃。 漏洞实践与修复 public class Test { public static void main(St

elasticsearch多字段聚合实现方式

1、背景 我们知道在sql中是可以实现 group by 字段a,字段b,那么这种效果在elasticsearch中该如何实现呢?此处我们记录在elasticsearch中的3种方式来实现这个效果。 2、实现多字段聚合的思路 实现多字段聚合的思路 从上图中,我们可以知道,可以通过3种方式来实现 多字段的聚合操作。 3、需求 根据省(province)和性别(sex)来进行聚合,然后

考研高等代数真题分类汇编02

已知证明:若在数域上不可约,则在数域上不可约. 证明:反证法.若在上可约,不妨设,其中为中次数大于零的多项式,则 而也为中次数大于零的多项式,所以也可约,矛盾. 证明多项式在有理数域上不可约. 证明:记则 取素数,明显有 于是由艾森斯坦判别法可知在有理数域上不可约,进而在有理数域上也不可约. 设为互异的整数,证明在有理数域上不可约 证明:反证法,若在有理数域上可约,则其一定分解为两个整

【AI+本地知识库】个人整理的几种常见本地知识库技术方案

之前关于本地知识库写过几篇文章。【人工智能】电脑本地从零开始搭建属于自己的大模型  ,  当时用的ollama  + Llama2 , 现在 Llama3都已经开源了, 该更新自己的技术储备了。 【人工智能】从0搭建行业智能机器人的几种选型技术方案智能机器人 和 本地知识库 其实很类似,技术方案是相通的, 都是想实现一个 对隐私安全要

【人工智能】CUDA是什么?一文揭开 NVIDIA CUDA 神秘面纱

CUDA(Compute Unified Device Architecture),是显卡厂商NVIDIA推出的运算平台。 CUDA™是一种由NVIDIA推出的通用并行计算架构,该架构使GPU能够解决复杂的计算问题。 它包含了CUDA指令集架构(ISA)以及GPU内部的并行计算引擎。 开发人员可以使用C语言来为CU

【单细胞】合并多个seurat数据对象

在实际中,经常存在多个样本一起联合分析的情况: 比如我们既可以按照样本来源显示聚类,也可以按照类型来显示聚类结果。 所以,我们测试利用seurat如何进行多个样本的合并分析。 下载官网的2组测试数据。 pbmc4k: p