本教程使用Seurat包进行10x Visium单细胞空间转录组数据分析。
这个教程涉及:
标准化
降维和聚类
检测空间差异表达基因
交互可视化
与单细胞转录组整合分析
整合切片信息
#1. R环境
## 检查Seurat版本
本教程:Seurat (>=3.2)
help(Seurat)
## 安装包:
# Enter commands in R (or R studio, if i
import java.util.List;
import java.util.stream.Collectors;
import java.util.stream.Stream;
public class FilerDemo {
public static void main(String[] args) {
List<Employee> list = Employee.getEmp
from PIL import Image
import os
import numpy as np
import torch
import torch.nn as nn
import copy
from torch.autograd import Variable
from torchvision import models
import matplotlib.cm as mpl_color_m